Kolagen, niezależnie od swego pochodzenia zawiera 19 aminokwasów, w tym 4- i 3- hydroksyprolinę (Hyp) oraz 5- hydroksylizynę (Hys). Występowanie hydroksyproliny jako specyficznego aminokwasu kolagenu wykorzystuje się praktycznie w metodach ilościowego oznaczania kolagenu, stosując odpowiednie przeliczniki.
Zawartość Hyp w kolagenie może się zmieniać w szerokim zakresie, w zależności od rodzaju i pochodzenia materiału kolagenowego.
Dzięki rozwojowi nowych metod analitycznych obecnie można ustalić wszystkie aminokwasy o znaczeniu biologicznym z dokładnością wystarczającą do osiągnięcia założonych celów teoretycznych, i praktycznych. Znane są metody grawimetryczne, fotometryczne, chromatograficzne, enzymatyczne i mikrobiologiczne do oznaczania aminokwasów w materiałach biologicznych.
